1604年1月，英国国王詹姆斯一世主持了一个宗教会议。为了调解各个教派之间的矛盾，会议做出了一个重大决定：用国王的名义出版钦定版《圣经》。
7月12日，荷兰人韦麻郎率大船三艘开入澎湖。1604年9月30日，在蛇夫座附近出现一颗新星，最亮时比木星还亮。开普勒对这颗新星进行了17个月的观测并发表了观测结果。历史上称它为开普勒新星。
1604年10月，福建都司沈有容率领战舰50艘驱逐进犯澎湖的荷兰人。
1604年12月29日，福建泉州海外发生8.0级地震，破坏甚者为泉州，有感范围达1000km，泉州莆田烈度达IX度，福州烈度也达VII度，是福州烈度最大的地震
李化龙请开泇河
万历三十二年（1604）正月十四日，总理河道工部右侍郎李化龙疏言：河自开封、归德而下，合运入海。其路有三：由兰阳道考成至李吉口，过坚城集入陆庄楼，出茶城而向徐、邳，是名浊河，为中路。由曹、单、丰沛出飞云桥，入龙塘、出徐沟而向徐、邳，是名银河，为北路。由潘家口过司家道，至何家堤，经符离，道睢宁，入宿迁，出小河口入运，是名符离河，为南路。南路接近祖陵，北路靠近运河。是名符离河，为南路。南路接近祖陵，北路靠近运河。唯中路既远于祖陵又济于运河，以前督臣力排众议，兴工开河，终因资金匮乏，不得完工。臣以为为今之计，唯守行堤，亟开泇河。其利有六：一、泇河开而运不借河，有水无水均可通运。二、可以二百六十里之泇河，避开三百三十里之黄河。三、运河不借黄河，则我为政得以熟察机宜而治之。四、估计费银二十万两，开河二百六十里，比以前朱衡开新河，可谓事半功倍。五、开泇河必行召募民夫，春荒时开工，夏麦熟时人散，富民不用赔累，穷民得以救济。六、粮船过河，尽在春天之后，害怕河水上涨，运入泇河，朝暮无妨。其不必怀疑者则二；一保护祖陵，为民抗灾；二徐州向来苦于水患，开泇河可以保护徐州城，安定徐州民心。是时，工科都给事中候庆远亦以为开泇河有益于民。神宗说：应审度详悉，及时兴工，如经费不敷，许其增加，务图久远之计。至同年八月，泇河开通。但为时不久，黄河又在丰县、沛县等处缺口，为害如故。
阁臣冒雨伏阙请罢矿税
万历三十二年（1604）五月二十三日，雷火击毁长陵明楼。神宗为此下诏讲求实政。大学士沈鲤请除矿税，并属同官沈一贯、朱赓各草一疏，等待时机呈上。一日，京师忽降大雨，沈鲤说：疏可以上了。皇上历来厌恶讲矿税事，不看这类的奏疏。今日我辈冒雨素服到文华门上奏，皇上必会感到惊讶而视之。于是他们诚心诚意地在雨中伏跪，请神宗惕然思省，翻然改过，速除矿税，勿轻视宗社，勿疏简政事。从辰时跪到午时，神宗还是不出来，最后派太监田义传旨：令他们“各守心供职，不要挟私沽名”。
赵世卿疏论矿税“六不可不罢”
万历三十二年（1604）五月，长陵明楼被雷火击毁时，户部尚书赵世卿上疏言：今日讲求实政，莫急于罢矿税。历来明王不贵异物，今矿税致民怨，为君德之计，不可不罢，此其一。取民无度，势将驱民从乱，致百姓群起反对朝廷，为国家之计，不可不罢，此其二。开山凿海，税及工商农民，而且操弓挟矢，残害良民，毁坏田庐，祸延鸡犬，数十年而不停止，为国体之计，不可不罢，此其三。税使四出，如虎如狼，到处挖墓，奸淫妇女，人无不怨恨，为民困之计，不可不罢，此其四。国家财赋，不在民间而在官府，今尽括入于奸人之室。以故不断催征旧欠税粮而积欠日多，不断征收关税而关税愈亏，库藏空，民贫如洗。为国课之计，不可不罢，此其五。天子之令，信如四时，陛下于三年前就下诏说：“朕心仁爱，自有停止之时”，今年复一年，更待何日！为诏令之计，亦不可不罢，此其六。请陛下试思：从服食，宫室，以至营造、征讨，何事不取于民，民何事不供上？百姓无负于国家，陛下何以不恤其难，岂能问心自安。今日灾变迭告，“欲回天意，在恤民心；欲恤民心，在罢矿税。无烦再计而决也。”赵世卿之疏呈上，神宗虽以为然，但终不罢矿税。
楚府宗人击杀赵可怀
楚王华奎贿赂大学士沈一贯，宗人华越上疏弹劾，被判以诬告罪。诸宗人皆不服，俱言华奎“伪迹昭著，行贿有据”。并到京城上告，明神宗不听，下旨切责诸宗人，罚禄削爵。万历三十二年（1604）秋，华奎又献银一万两资助大兴土木。诸宗人疑其输贿，渡江拦劫，湖广巡抚赵可怀令有司捕治宗人。宗人恨赵可怀治狱不公，庇护华奎，于同年闰九月二十四日集数百人持刀突入巡抚衙门，当场杀死赵可怀。神宗命逮捕诸宗人，有七十三人坐狱问罪。成为当时轰动远近的大案。次年四月，赠湖广巡抚兵部尚书赵可怀为太子太保，荫中书舍人，予祭葬。同时将为首的楚府宗人蕴珍金、蕴鍧处斩，赐华堆等三人自尽，华嫶等二十三人禁锢狱中，蕴钫等二十二人革职闲住，蕴鎏等十八人降爵革禄，并停其待封者。
兵部奏报赏赐外夷布匹额数
万历三十二年（1604）十一月十七日，兵部言：赏给外夷布匹，查历年所买为十三万八千三百七十三匹。今改买山东粗布，增加一万三千二百九十二匹。每布三千匹为一车，计布填车。赴江南苏、杭所用船只、廪粮、马匹，亦酌填勘合，不许阻难，以及委官夹带需索。神宗可其奏。

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